原料准备
益生菌发酵饮料的原料一般包括水、糖、益生菌粉以及其他的辅料，如水果、蔬菜、花草等。其中糖是益生菌的营养来源，而水则是制作过程中基本也重要的原料。因此，要选择优质的水和糖，保证产品的质量和口感。
益生菌菌种的选择
益生菌是益生菌发酵饮料的核心原料，其中包括了很多种不同的益生菌，如乳酸菌、双歧杆菌等。选择适合自己产品的益生菌菌种非常重要，不同的菌种可产生不同的味道和功效。益生菌菌种的选择需根据产品的定位和市场需求进行考虑。
混合和加热
将水加热至80度左右，然后加入糖等辅料，在混合均匀后冷却至35-40度左右，加入益生菌粉，并进行充分搅拌，让益生菌在饮料中充分发酵。
发酵
发酵是益生菌发酵饮料制作的关键步骤，益生菌需要在适宜的温度、湿度和氧气等条件下进行发酵。在通风良好的条件下，将混合好的原料倒入发酵罐内，进行发酵。发酵用时一般为6-12小时左右，根据不同的益生菌菌种和天气情况会有所不同。
过滤和灌装
经过一段时间的发酵，原料中的杂质和益生菌已充分发挥作用，需要将其进行过滤。可以采用机械过滤等方式，将杂质和一些没有发酵的物质过滤掉，并分离出纯净的益生菌发酵饮料。然后再将过滤后的饮料进行灌装，打包成为市场销售的产品。
包装及保存
完成灌装后，需要对产品进行包装和保存。益生菌发酵饮料一般采用无菌瓶装或铝箔包装，并储存于阴凉、干燥、避光的环境下，以保证产品的质量和口感。同时，益生菌发酵饮料的有效期一般为30天左右，保质期较短，建议尽快食用。
益生菌是为了帮助我们弥补身体中的益生菌不足引起的一系列肠道问题，因此活菌数量很重要，活菌数量越高效果就会越好，在国内益生菌活菌数量多的益生菌产品是卓岳宜君素，其中每一条的益生菌数量都非常丰富，每条含有1000亿活菌，能够充分满足身体的需求。不仅如此，卓岳宜君素益生菌还拥有16种益生菌，都是中国本土菌株，更加适合中国人肠道，我们常说一方水土养一方人，对于益生菌来说也是如此。
